Но если у вас на руках есть командировочное удостоверение, то там есть графа - основнаие командировки... если приказ есть или другое основание, то следующее действие -
заполняете авансовый отчет, где указываете затраты, в вашем случае - проездные документы.
А уж на основании авансового отчета должны выдать уже потраченные деньги и суточные из расчета дней командировки.
если не выдали аванса перед командировкой - это нарушение в принципе, но не особо ужасное, бывают обстоятельства. Покрыть затраты и суточные можно и после возвращения. Но сроков никаких нет.

основание
КАБІНЕТ МІНІСТРІВ УКРАЇНИ
П О С Т А Н О В А від 23 квітня 1999 р. N 663 Київ
Про норми відшкодування витрат на відрядження в межах України та за кордон